遗传群体多态信息含量检测
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发布时间:2025-05-28 19:08:15 更新时间:2025-06-09 23:27:47
点击:0
作者:中科光析科学技术研究所检测中心


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遗传群体多态信息含量(Polymorphism Information Content, PIC)是评估遗传标记多态性和群体遗传多样性的重要指标,广泛应用于遗传育种、物种进化分析、种群遗传结构研究及生物资源保护等领域。其核心是通过量化特定遗传标记在群体中的信息含量,为筛选高价值分子标记、优化遗传图谱构建以及解析性状关联性提供科学依据。随着分子生物学技术的快速发展,PIC检测已成为现代遗传学研究的基础性工具,尤其在作物改良和濒危物种保护中具有不可替代的作用。
遗传多态信息含量检测的核心项目包括:
1. 微卫星标记(SSR)多态性分析:通过检测重复单元数量变异评估位点信息量;
2. 单核苷酸多态性(SNP)分型:基于碱基替换频率计算群体多样性;
3. 插入缺失(InDel)检测:分析长短序列变异对遗传信息的影响;
4. 限制性片段长度多态性(RFLP)评估:通过酶切位点差异判断多态性水平。
实现精准检测需依赖以下关键设备:
- 高通量PCR扩增仪:用于SSR和SNP标记的DNA片段扩增;
- 毛细管电泳系统(如ABI 3730xl):精确分离不同长度DNA片段;
- 二代测序平台(Illumina NovaSeq):实现全基因组SNP扫描;
- 生物分析仪(Agilent 2100):评估DNA/RNA质量及片段分布;
- 荧光定量PCR仪:用于等位基因频率定量分析;
- 基因芯片扫描仪:高通量SNP分型检测。
主流检测技术包括:
1. SSR标记分析流程:
- DNA提取与纯化 → 特异性引物设计 → PCR扩增 → 电泳分离 → 条带图像采集 → 等位基因频率统计 → PIC值计算(公式:PIC=1-Σ(Pi²)-Σ(2Pi²Pj²),Pi、Pj为等位基因频率)
2. SNP分型技术:
- 全基因组重测序 → 变异位点筛选 → 最小等位基因频率(MAF)计算 → 基于Hardy-Weinberg平衡评估位点适用性
3. 复合检测方法:
- 结合KASP(竞争性等位基因特异性PCR)与HRM(高分辨率熔解曲线)技术,实现多态位点快速筛查
国际通用的质量控制标准包括:
1. PIC值评价标准:
- 高多态性位点:PIC≥0.5(SSR标记)
- 中度多态性位点:0.25≤PIC<0.5
- 低多态性位点:PIC<0.25
2. SNP标记筛选标准:
- MAF≥0.05(群体样本量>100时)
- 基因型检出率≥90%
3. 数据质量控制标准:
- 重复样本一致性≥99%
- Hardy-Weinberg平衡检验P值>0.001
4. 行业规范依据:
- ISO 20387:2018《分子遗传学检测通用要求》
- GB/T 38576-2020《农业植物品种真实性鉴定标准》
通过系统化的检测流程、精密仪器支持及标准化的数据分析,遗传群体多态信息含量检测能够为遗传资源评价、分子标记辅助育种等提供可靠的数据支撑。未来随着单细胞测序和第三代测序技术的发展,检测精度和应用范围将进一步提升。
证书编号:241520345370
证书编号:CNAS L22006
证书编号:ISO9001-2024001
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