非靶向代谢组学(Untargeted metabolomics)是指采用 LC-MS、GC-MS、NMR技术,无偏向性的检测细胞、组织、器官或 者生物体内受到刺激或扰动前后所有小分子代谢物(主要是相对分子量1000 Da以内的内源性小分子化合物) 的动态变化,并通过生信分析筛选差异代谢物,对差异代谢物进行通路分析,揭示其变化的生理机制。
代谢组平台比较
| 分析技术 | 灵敏度 | 优点 | 缺点 |
|---|---|---|---|
| 核磁共振 NMR | 10-16 | 无创检测,样品需求量小; . 特异性高,能够对代谢物同时进行定性和定量 | 动态范围有限,灵敏度较低; 硬件投资较大 |
| 气质联用. GC-MS | 10-12 | 灵敏度高,分离效果好,数据库较为健全 | 样品处理过程较为繁琐,难挥发 性物质或半挥发性物质需进行衍生化 |
| 液质联用 LC-MS | 10:15 | 灵敏度高,分辨率高,可分析不稳定、 不易衍生化、难挥发和分子量较大的代谢物 | 大部分为自建数据库 有一定的限制性 |
非靶向代谢组学(Untargeted Metabolomics)是一种全面分析生物样本中所有可检测代谢物的方法,不事先设定特定代谢物目标。这种方法尝试捕捉样本中尽可能多的代谢物信号,包括未知和预期之外的代谢物,从而提供一个全局视图来研究生物系统的代谢状态变化。
方法特点
- 全面性:不局限于特定的代谢物或代谢途径,能够探测到大量已知和未知的代谢物。
- 探索性:适用于发现研究,帮助揭示未知的代谢途径和生物过程。
- 数据密集:产生大量的数据,需要复杂的数据处理和分析技术。
- 技术依赖:高度依赖于质谱(MS)和核磁共振(NMR)等高通量技术的发展。
应用
- 生物标志物的探索:在没有预设假设的情况下,寻找与特定疾病或生物状态相关的代谢物。
- 代谢途径的发现:帮助揭示生物体中未知的代谢途径和机制。
- 疾病机理研究:理解疾病的代谢背景,揭示疾病发展的代谢变化。
- 环境与营养研究:评估外界因素如环境污染、饮食变化对代谢的影响。
技术挑战
- 数据处理:由于产生大量复杂的数据,因此需要高效的数据处理和分析技术。
- 代谢物鉴定:未知代谢物的鉴定是一个挑战,需要结合先进的质谱数据库和生物信息学工具。
- 生物学解释:将检测到的代谢变化与具体的生物学过程相关联,解释其生物学意义。
非靶向代谢组学为理解复杂生物系统提供了一种强有力的方法,尤其在代谢研究领域,通过它能够开展无偏见的代谢物检测和分析,揭示生物体内深层次的代谢变化和相互作用。
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