靶向lncRNA单细胞全转录组测序
1对1客服专属服务,免费制定检测方案,15分钟极速响应
发布时间:2024-05-21 08:15:32 更新时间:2025-02-05 15:52:39
点击:13
1对1客服专属服务,免费制定检测方案,15分钟极速响应
发布时间:2024-05-21 08:15:32 更新时间:2025-02-05 15:52:39
点击:13
长非编码RNA(lncRNA)在许多重要的生物过程中起着关键作用,包括发育、疾病和癌症。但是,这些lncRNAs在单细胞水平上的表达和功能尚不清楚。为了更好地理解这些lncRNAs在单细胞水平上的表达和功能,可以采用靶向lncRNA的单细胞全转录组测序技术。
这种技术的步骤可能包括:
这种方法可以帮助研究者理解在某些特定细胞中,特定的lncRNA是如何表达的,以及这些lncRNA可能如何影响细胞的功能。
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200nt,没有蛋白质编码能力,或只能编码短肽的RNA分子。在过去的几十年中,研究者们逐渐认识到lncRNA的重要性,发现lncRNA在细胞分化、生长发育、免疫应答、基因转录调控、RNA加工修饰等方面具有重要的调节作用[1-4]。然而,由于lncRNA的丰度普遍较低,一般只有mRNA的十分之一左右[5]。传统的测序技术包括单细胞测序技术在低丰度转录本(比如lncRNA)的检测上存在灵敏度不高和检测不准确等问题,在测序建库过程中,对低丰度的转录本进行特异性的靶向扩增,则可以实现对这些转录本更灵敏、更准确的检测。为此,我们设计了针对lncRNA的靶向panel,包含315个和148个已报道的,与人或小鼠生物学功能或疾病相关的功能性lncRNA。在单细胞测序建库过程中,使用lncRNA靶向panel对功能性lncRNA分子进行多重PCR扩增,极大的提高了lncRNA的检测灵敏度和准确性,使得在单细胞水平分析低丰度、功能性lncRNA表达情况成为可能。
证书编号:241520345370
证书编号:CNAS L22006
证书编号:ISO9001-2024001
版权所有:北京中科光析科学技术研究所京ICP备15067471号-33免责声明