癌症多组学
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发布时间:2024-05-21 08:15:32 更新时间:2025-02-05 15:52:39
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基因组+转录组+表观基因组
从表观调控到基因组变异和转录表达,揭示癌症调控 网络与癌症组学特征。
基因组+转录组+蛋白质组+磷酸化蛋白质组
根据中心法则全面分析癌症样本各维度变异信息,助 力癌症临床分子诊疗应用。
分析内容
基因组 | 转录组 | 表观基因组 | 蛋白质组 | 磷酸化蛋白质组 |
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体细胞突变检测(Somatic SNV/Indel/CNV/SV) 高频突变基因分析 驱动基因筛选和预测 突变特征分析 CNV 分布和高频 CNV 分析 肿瘤纯度与倍性 新抗原预测 进化分析 |
差异表达分析 功能富集分析 结构分析 免疫分析 |
差异表达分析 功能富集分析 蛋白互作分析 |
差异表达分析 功能富集分析 蛋白互作分析 |
差异表达分析 功能富集分析 蛋白互作分析 Motif 分析 修饰位点分析 激酶分析 |
基因组 + 转录组 + 蛋白质组 | 基因组 + 转录组 + 蛋白质组 +磷酸化蛋白 质组 | 基因组 + 转录组 + 表观基因组 | 基因组 + 转录组 + 表观基 因组 + 蛋白质组 | 基因组 + 转录组 + 表观基因组 + 蛋 白质 + 磷酸化蛋白质组 | |
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eQTL |
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基因组 + 表观基因组 |
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差异甲基化区域 与 RNA 表达相关性分析 |
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送样建议
研究样本 | 对照样本 | 推荐样本量 |
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肿瘤组织 | 血液样本(DNA 对照,优先提供) | ≥ 50 个患者 |
癌旁正常组织(DNA/DNA 甲基化 /RNA/ 蛋白) |
DNA/RNA/ 蛋白质共提取:仅提取一份样本,同时满足基因组、转录组和蛋白质组三个组学测序。
样本类型 | 送样量 | 储存与运输 |
---|---|---|
组织 | 20 mg | -80℃保存,干冰运输 |
细胞 | 5×106 ~1×107 离心收集细胞沉淀,-80℃保存,干冰运输 | 离心收集细胞沉淀,-80℃保存,干冰运输 |
单组学提取:每个组学分别提供如下样本量提取。
样本类型 | 送样量 | 储存与运输 |
---|---|---|
组织 | ≥ 50 mg | -80℃保存,干冰运输 |
血液 | ≥ 1 mL | |
细胞 | ≥ 1×107 | 离心收集细胞沉淀,-80℃保存,干冰运输 |
证书编号:241520345370
证书编号:CNAS L22006
证书编号:ISO9001-2024001
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