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发布时间：2024-05-21 08:15:32 更新时间：2024-08-14 16:44:15
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基因组+转录组+表观基因组
从表观调控到基因组变异和转录表达，揭示癌症调控 网络与癌症组学特征。
基因组+转录组+蛋白质组+磷酸化蛋白质组
根据中心法则全面分析癌症样本各维度变异信息，助 力癌症临床分子诊疗应用。
分析内容
| 基因组 | 转录组 | 表观基因组 | 蛋白质组 | 磷酸化蛋白质组 |
|---|---|---|---|---|
| 体细胞突变检测（Somatic SNV/Indel/CNV/SV） 高频突变基因分析 驱动基因筛选和预测 突变特征分析 CNV 分布和高频 CNV 分析 肿瘤纯度与倍性 新抗原预测 进化分析 |
差异表达分析 功能富集分析 结构分析 免疫分析 |
差异表达分析 功能富集分析 蛋白互作分析 |
差异表达分析 功能富集分析 蛋白互作分析 |
差异表达分析 功能富集分析 蛋白互作分析 Motif 分析 修饰位点分析 激酶分析 |
| 基因组 + 转录组 + 蛋白质组 | 基因组 + 转录组 + 蛋白质组 +磷酸化蛋白 质组 | 基因组 + 转录组 + 表观基因组 | 基因组 + 转录组 + 表观基 因组 + 蛋白质组 | 基因组 + 转录组 + 表观基因组 + 蛋 白质 + 磷酸化蛋白质组 | |
|---|---|---|---|---|---|
| eQTL |
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| 基因组 + 表观基因组 |
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差异甲基化区域 与 RNA 表达相关性分析 |
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送样建议
| 研究样本 | 对照样本 | 推荐样本量 |
|---|---|---|
| 肿瘤组织 | 血液样本（DNA 对照，优先提供） | ≥ 50 个患者 |
| 癌旁正常组织（DNA/DNA 甲基化 /RNA/ 蛋白） |
DNA/RNA/ 蛋白质共提取：仅提取一份样本，同时满足基因组、转录组和蛋白质组三个组学测序。
| 样本类型 | 送样量 | 储存与运输 |
|---|---|---|
| 组织 | 20 mg | -80℃保存，干冰运输 |
| 细胞 | 5×106 ~1×107 离心收集细胞沉淀，-80℃保存，干冰运输 | 离心收集细胞沉淀，-80℃保存，干冰运输 |
单组学提取：每个组学分别提供如下样本量提取。
| 样本类型 | 送样量 | 储存与运输 |
|---|---|---|
| 组织 | ≥ 50 mg | -80℃保存，干冰运输 |
| 血液 | ≥ 1 mL | |
| 细胞 | ≥ 1×107 | 离心收集细胞沉淀，-80℃保存，干冰运输 |
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